光电仪器操作师合格发证机关是指负责对光电仪器操作师进行资格认证、考核和发证的政府部门或机构，这些部门或机构通常隶属于国家或地方政府，具有一定的行政权力和权威性，负责制定相关政策、标准和技术规范，对光电仪器操作师的培训、考核和发证工作进行监督管理。

光电仪器操作师合格发证机关主要包括以下几个部门：

1、国家人力资源和社会保障部：人力资源和社会保障部是国务院组成部门之一，负责全国职业技能培训、职业资格认证等工作，在光电仪器操作师培训和发证方面，人社部会与其他相关部门密切合作，共同制定相关政策和标准。

2、国家科技部：科技部是国务院组成部门之一，负责全国科技创新、高新技术产业发展等工作，在光电仪器操作师培训和发证方面，科技部会关注光电仪器行业的发展动态，为光电仪器操作师提供技术支持和指导。

3、国家市场监督管理总局：市场监管总局是国务院组成部门之一，负责全国市场监管、反垄断等工作，在光电仪器操作师培训和发证方面，市场监管总局会监督和管理光电仪器操作师培训市场，确保培训质量和证书的合法性。

4、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):各级人力资源和社会保障厅(局)在地方层面负责本行政区域内的光电仪器操作师培训和发证工作，各级人社厅(局)会与当地光电仪器企业、职业培训机构等合作，开展光电仪器操作师培训和考核工作。

5、各省、自治区、直辖市科技厅(委):各级科技厅(委)在地方层面负责本行政区域内的光电仪器行业发展和技术创新工作，各级科技厅(委)会关注光电仪器行业的发展需求，为光电仪器操作师提供技术指导和支持。

6、各省、自治区、直辖市市场监管局：各级市场监管局在地方层面负责本行政区域内的市场监管工作，各级市场监管局会监督和管理光电仪器操作师培训市场，确保培训质量和证书的合法性。

光电仪器操作师合格发证机关是一个涉及多个政府部门和机构的体系，包括国家和地方层面的各级政府、人力资源和社会保障部、科技部、市场监管总局以及各省、自治区、直辖市的相关厅(局、委)，这些部门和机构共同参与光电仪器操作师的培训、考核和发证工作，确保光电仪器操作师具备专业技能和素质，为光电仪器行业的发展做出贡献。