家庭教育指导师的证书版本有很多种，主要包括以下几种：

中国国家人力资源和社会保障部颁发的家庭教育指导师(高级)职称证书，这是最权威的家庭教育指导师证书，需要通过严格的考试和实践经验的积累才能获得。

中国心理学会(CPA)颁发的家庭教育心理咨询师证书，这种证书主要针对家庭教育中的心理咨询方面，需要具备一定的心理学知识和技能。

各省市教育局或人力资源社会保障局颁发的家庭教育指导师证书，这类证书通常由各地政府主导，内容和标准可能会有所不同，但也具有一定的权威性。

国际认证的家庭教育指导师证书，如美国婚姻家庭治疗师协会(AFT)颁发的认证家庭治疗师证书(CFT)，这类证书需要通过美国相关机构的考核和认证。

一些专业培训机构或教育机构自行颁发的家庭教育指导师证书，这类证书的权威性和可信度相对较低，选择时需要谨慎。

在选择家庭教育指导师证书时，建议考虑以下几点：

了解证书的颁发机构和背景，选择有权威性的机构颁发的证书。

关注证书的内容和标准，确保与家庭教育指导师的工作职责和要求相符。

考虑个人的兴趣和发展需求，选择适合自己的证书版本。

了解持证人在行业内的声誉和认可度，以便更好地开展工作。

家庭教育指导师的证书版本有很多种，选择时要综合考虑各方面因素，以确保所获得的证书能够提升自己的专业素养和竞争力，家庭教育指导师还需要不断提升自己的专业知识和实践能力，为家长提供更高质量的服务。