家庭教育指导师颁证机构是由多个部门共同管理的，这些部门包括：人力资源和社会保障部、国家卫生健康委员会、教育部、国家市场监督管理总局等，人力资源和社会保障部负责制定家庭教育指导师的职业标准和培训大纲，组织编写教材和试题，开展职业技能鉴定工作；国家卫生健康委员会则负责对家庭教育指导师的身体健康状况进行审核；教育部则负责对家庭教育指导师的学历和专业背景进行审核；国家市场监督管理总局则负责对家庭教育指导师的资格认证进行监管。

还有一些地方性的颁证机构，如各省市人力资源和社会保障局、卫生健康委员会、教育局等，也会对家庭教育指导师进行管理和认证，这些颁证机构会根据各自的职责和权限，对申请者进行相应的审核和评估，并颁发相应的证书。

家庭教育指导师颁证机构的管理涉及到多个部门和层面，需要各方面共同努力，确保颁证工作的公正、透明和有效性，也需要广大家长和社会公众的关注和支持，共同推动家庭教育指导事业的发展。