家庭疗愈师证书的颁发主要由一些专业的教育机构和认证机构负责，这些机构通常会对家庭疗愈师进行系统的培训，并对其进行考核，通过后才能颁发相应的证书，以下是一些颁发家庭疗愈师证书的机构：

1、国际家庭治疗师协会(International Association of Family Therapists,IAFT):IAFT是一个专门从事家庭治疗师培训和认证的国际组织，该组织在全世界范围内设有分支机构，可以为学员提供专业的培训和认证服务。

2、美国家庭治疗师协会(American Association for Marriage and Family Therapy,AAMFT):AAMFT是美国最大的家庭治疗师专业组织，也是美国国家家庭治疗师资格认证委员会(National Board for Certified Family Therapy Specialists,NBCFTS)的授权机构，通过AAMFT的认证考试，可以获得家庭治疗师资格证书。

3、加拿大家庭治疗师协会(Canadian Association of Family Therapists,CAFT):CAFT是加拿大最大的家庭治疗师专业组织，也可以为学员提供专业的培训和认证服务。

4、中国心理卫生协会(Chinese Psychological Association,CPA):中国心理卫生协会是中国最早的心理学专业组织之一，也可以为家庭疗愈师提供专业的培训和认证服务。

5、其他一些国家和地区也有自己的家庭治疗师认证机构，如英国、澳大利亚、新西兰等。

需要注意的是，不同的机构可能会有不同的认证标准和要求，因此在选择颁发家庭疗愈师证书的机构时，需要仔细研究其认证流程、培训内容和费用等信息，以确保所获得的证书具有较高的权威性和认可度，由于家庭疗愈师的工作涉及个人隐私和敏感信息，因此在选择培训机构时，还需要考虑其是否具备足够的保密措施和职业道德规范。