心理疗愈师证书的颁发部门有很多，不同的部门可能有不同的优势和特点，以下是一些比较常见的心理疗愈师证书颁发部门：

1、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是我国卫生行业的主管部门，负责制定和实施卫生政策、法规和标准，在心理疗愈领域，国家卫生健康委员会也会颁发相关的证书和资格认证。

2、中国心理学会：中国心理学会是我国心理学领域的权威组织，拥有众多专业会员和专家学者，该组织会定期举办心理咨询师、心理治疗师等职业资格考试，并颁发相应的证书。

3、各省市人力资源和社会保障局：各省市人力资源和社会保障局也会颁发心理疗愈师等相关职业资格证书，这些证书在当地具有一定的认可度和权威性。

4、各大高校心理健康教育中心：许多高校都设有心理健康教育中心，为学生提供心理咨询、心理辅导等服务，这些中心通常也会开展心理疗愈师等相关职业资格认证培训课程，并颁发相应的证书。

5、国际认证机构：如美国心理学会(APA)等国际知名心理学组织也会颁发心理疗愈师等相关职业资格证书，这些证书在国际上具有一定的认可度和权威性。

选择哪个部门颁发的心理疗愈师证书主要取决于您所在地区的需求和实际情况，建议您可以先了解一下当地政府、高校、企事业单位等方面的政策和要求，再根据自己的兴趣和发展方向做出选择，不同部门颁发的证书在实际应用中可能会有所差异，您也可以根据自己的需求和目标来权衡各种因素。