针灸师证和针灸门诊证是两个不同的概念，针灸师证是指通过国家中医药管理部门组织的针灸师资格考试获得的证书，证明持有人具备从事针灸工作的资格，而针灸门诊证是指在医疗机构开设针灸诊疗服务所需的执业许可证，需要向当地卫生健康部门申请办理。
根据《中华人民共和国医师法》和《中华人民共和国护士法》的规定，从事中医诊疗活动的人员必须取得相应的执业资格证书，如果你想在医疗机构开设针灸门诊，你需要先获得针灸师证，然后再向当地卫生健康部门申请办理针灸门诊证。
目前，全国各地的卫生健康部门对于针灸师证和针灸门诊证的办理要求可能会有所不同，具体情况需要咨询当地的卫生健康部门或者相关机构，你需要满足一定的学历、年龄、工作经验等条件才能参加相应的考试并获得证书。
想要在医疗机构开设针灸门诊，你需要先获得针灸师证，然后再向当地卫生健康部门申请办理针灸门诊证，具体的办理流程和要求可能因地区而异，建议咨询当地的卫生健康部门或者相关机构了解详细情况。