运动康复师证发证机构主要是指那些具有权威性和专业性的组织，负责对运动康复师的专业技能和知识进行认证，这些发证机构的认可对于运动康复师的职业发展具有重要意义，因为只有获得这些机构的认可，运动康复师才能在相关领域得到更好的发展机会，以下是一些常见的运动康复师证发证机构：
1、国家体育总局体育科学研究所：国家体育总局体育科学研究所是我国体育科学研究的最高学术机构，负责对我国体育科学研究的发展进行指导和管理，该所下属的运动康复与健康研究中心，负责运动康复领域的研究工作，包括运动康复师的培训和认证工作。
2、中国康复医学会：中国康复医学会是我国康复医学领域的最高学术组织，负责对我国康复医学的研究和发展进行指导和管理，该会设有康复医师专业委员会，负责康复医师的培训和认证工作，其中包括运动康复师的认证。
3、国际物理治疗与康复学会(International Society of Physical Therapy and Rehabilitation, ISPTR):国际物理治疗与康复学会是全球物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对全球物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
4、美国物理治疗协会(American Physical Therapy Association, APTA):美国物理治疗协会是全球物理治疗领域的最高学术组织，负责对全球物理治疗的研究和发展进行指导和管理，该协会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
5、欧洲物理治疗与康复学会(European Institute of Physical Therapy and Rehabilitation, EIPTR):欧洲物理治疗与康复学会是欧洲物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对欧洲物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
6、亚洲物理治疗与康复学会(Asian Physiotherapy & Rehabilitation Association, APTRA):亚洲物理治疗与康复学会是亚洲物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对亚洲物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
7、澳大利亚物理治疗与康复学会(Australian Physiotherapy and Rehabilitation Association, APTRA):澳大利亚物理治疗与康复学会是澳大利亚物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对澳大利亚物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
8、加拿大物理治疗与康复学会(Canadian Physiotherapy and Rehabilitation Association, CPRTA):加拿大物理治疗与康复学会是加拿大物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对加拿大物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
9、新加坡物理治疗与康复学会(Singapore Physiotherapists Association, SPTA):新加坡物理治疗与康复学会是新加坡物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对新加坡物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
10、马来西亚物理治疗与康复学会(Malaysia Physiotherapists Association, MPTA):马来西亚物理治疗与康复学会是马来西亚物理治疗与康复领域的最高学术组织，负责对马来西亚物理治疗与康复的研究和发展进行指导和管理，该学会设有物理治疗师认证委员会，负责对物理治疗师的认证工作，其中包括运动康复师的认证。
还有一些地方性的运动康复师证发证机构，如各省、市、自治区体育局下属的运动康复中心等，这些单位在各自的行政区域内具有一定的权威性，对于当地的运动康复师培养和选拔具有重要作用。
运动康复师证发证机构主要包括国家级、省级和地方级的体育科学研究机构、学术组织以及专业协会等，这些发证机构的认可对于运动康复师的职业发展具有重要意义，运动康复师在选择发证机构时应该根据自己的实际情况和发展方向进行综合考虑。