国际商务单证员证书颁发机构主要负责实施和管理国际商务单证员的培训、考核和发证工作，这些机构通常由各国政府或国际组织设立，以确保国际商务单证员具备一定的专业知识和技能，能够胜任跨国贸易中的单证业务，以下是一些主要的国际商务单证员证书颁发机构：
1、中华人民共和国国家外国专家局(原人事部)
中国国家外国专家局是负责管理和组织实施引进国外人才计划的政府部门，自2003年起，该局开始负责国际商务单证员的培训和考核工作，国家外国专家局与国际商会(ICC)等国际组织合作，共同制定培训大纲和考试标准，对参加培训和考试的学员进行认证，通过考试并获得证书的人员，可以在中国境内从事国际贸易中的单证业务。
2、国际商会(International Chamber of Commerce,ICC)
国际商会是一个全球性的非营利性行业组织，成立于1919年，ICC在全球范围内设有多个分会和代表处，包括中国分会，ICC与中国国家外国专家局合作，共同开展国际商务单证员培训项目，通过ICC认证的国际商务单证员，可以在中国境内从事国际贸易中的单证业务。
3、亚太经合组织(Asia-Pacific Economic Cooperation,APEC)
亚太经合组织是一个区域性的经济合作组织，成立于1989年，APEC成员国包括中国在内，共有21个经济体，APEC内部有一个专门负责贸易和投资便利化的小组，负责推动各成员国在贸易和投资领域的政策协调和合作，该小组与中国国家外国专家局等相关部门合作，为国际商务单证员提供培训和认证服务。
4、世界贸易组织(World Trade Organization,WTO)
世界贸易组织是一个全球性的多边贸易组织，成立于1995年，WTO的主要目标是促进全球贸易自由化和经济一体化，WTO与中国国家外国专家局等相关部门保持密切合作，共同推动国际商务单证员培训和认证工作，通过WTO认证的国际商务单证员，可以在中国境内从事国际贸易中的单证业务。
5、其他国际组织和培训机构
除了上述几个主要的国际商务单证员证书颁发机构外，还有一些其他国际组织和培训机构也提供相关的培训和认证服务，联合国贸发会议(UNCTAD)和欧洲对外贸易中心(ECTW)等国际组织，以及一些知名的培训机构如Deloitte、KPMG等，都提供国际商务单证员的培训课程和认证服务。
国际商务单证员证书颁发机构主要包括各国政府或国际组织的相关部门，如中国国家外国专家局、国际商会、亚太经合组织、世界贸易组织等，还有一些其他国际组织和培训机构也提供相关的培训和认证服务，这些机构共同努力，确保国际商务单证员具备一定的专业知识和技能，能够胜任跨国贸易中的单证业务。