全国外贸单证员证书颁发机构是中华人民共和国商务部，商务部是国务院组成部门，负责制定和实施对外贸易政策、法规，推动对外经济贸易合作与交流，管理和监督对外贸易经营活动，以及组织实施国际贸易促进和调整措施等。
外贸单证员是指在外贸企业、进出口商品交易会、对外经济贸易洽谈会等场合从事外贸单证工作的人员，外贸单证员的主要职责是负责办理进出口货物的报关、报检、保险、结汇等手续，以及制作、审核、签发各类外贸单证，如出口货物装箱单、发票、提单、保险单等。
为了规范外贸单证员的职业行为，提高其业务水平，确保外贸单证的质量和效率，我国自1990年起开始实行外贸单证员职业资格制度，经过多年的发展和完善，全国外贸单证员证书已经成为衡量外贸单证员业务能力的重要标志。
全国外贸单证员证书的颁发工作由商务部负责，商务部设立了专门的外贸单证员职业资格考试办公室，负责组织、协调和管理全国外贸单证员职业资格考试工作，考试内容包括外贸业务知识、单证制作技能、法律法规等方面的内容，旨在全面测试考生的综合素质和实际操作能力。
考试合格者由商务部颁发全国外贸单证员证书，持有全国外贸单证员证书的人员，可以在外贸企业、进出口商品交易会、对外经济贸易洽谈会等场合从事外贸单证工作，也可以在政府部门、行业协会、研究机构等单位从事外贸政策研究、培训指导等工作。
为了满足不断发展的外贸业务需求，商务部还不断完善和优化外贸单证员职业资格制度，近年来，商务部逐步推行外贸单证员职业资格分级管理，将外贸单证员分为初级、中级和高级三个等级，以适应不同层次、不同领域的外贸业务需求，商务部还加强与其他国家和地区的合作与交流，引入国际先进的外贸单证理论和实践经验，不断提高我国外贸单证员的专业素质和服务水平。
全国外贸单证员证书颁发机构是中华人民共和国商务部，商务部作为国务院组成部门，肩负着制定和实施对外贸易政策、法规的重要职责，对全国外贸单证员证书的颁发和管理具有重要的权威性和影响力，通过全国外贸单证员职业资格考试和证书制度的实施，我国外贸行业已经培养了大量的专业人才，为我国对外贸易的发展做出了积极的贡献。