财务管理师证书发证机关是指负责颁发财务管理师职业资格证书的政府部门或机构，在中国，财务管理师证书的发证机关主要由人力资源和社会保障部、财政部、国家工商行政管理总局等部门共同负责，这些部门根据《财务管理师职业标准》和相关法律法规，对申请人进行严格的资格审核，确保财务管理师具备相应的专业知识和实践能力。
人力资源和社会保障部是财务管理师证书的主要发证机关之一，该部门负责制定和完善财务管理师职业标准，组织实施全国财务管理师职业资格鉴定工作，对合格的申请人颁发财务管理师职业资格证书，人力资源和社会保障部还负责对财务管理师职业资格鉴定工作进行监督和管理，确保鉴定工作的公正、公平、公开。
财政部作为财务管理师证书的发证机关之一，主要负责财务管理师职业资格证书的管理和使用，财政部会对财务管理师职业资格证书进行备案管理，确保证书的真实性和有效性，财政部还会对财务管理师职业资格证书的使用进行规范和指导，推动财务管理师职业资格制度的健康发展。
国家工商行政管理总局作为财务管理师证书的发证机关之一，主要负责对财务管理师职业资格证书的注册管理，国家工商行政管理总局会对财务管理师进行注册登记，确保财务管理师具备相应的专业知识和实践能力，国家工商行政管理总局还会对财务管理师的执业行为进行监管，维护市场秩序和消费者权益。
各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)、财政厅(局)也会参与到财务管理师证书的发证工作中，负责本地区财务管理师职业资格鉴定和证书发放的具体工作，各级人力资源社会保障部门和财政部门会密切配合，共同推进财务管理师职业资格制度的建设和发展。
财务管理师证书发证机关是一个涉及多个部门的综合性机构，包括人力资源和社会保障部、财政部、国家工商行政管理总局等，这些部门共同负责财务管理师职业资格证书的发放和管理，确保财务管理师具备相应的专业知识和实践能力，为社会经济发展提供有力支持。