中医针灸师证办理机构主要包括以下几类单位：
1、中医药院校：中医药院校是培养中医针灸师的主要基地，这些学校通常设有中医针灸专业，包括基础理论课程、实践操作课程等，在校学生在完成学业后，可以参加国家中医药管理局组织的中医针灸师资格考试，通过考试后即可获得中医针灸师证书，一些中医药院校还与医疗机构合作，为毕业生提供实习和就业机会。
2、中医药培训机构：随着人们对中医药的重视程度不断提高，各类中医药培训机构也应运而生，这些机构主要为社会提供中医针灸师培训服务，帮助有志于从事中医针灸工作的人员提升专业技能，培训内容包括中医基础理论、针灸技术、推拿按摩等，学员在完成培训后，可以参加相应的资格考试，取得中医针灸师证书，目前市面上有很多知名的中医药培训机构，如北京中医药大学东方医院、上海中医药大学附属曙光医院等。
3、卫生健康行政部门：各级卫生健康行政部门负责监管和管理本地区的中医药工作，其中包括中医针灸师的培训、考试和发证等工作，在各地卫生健康行政部门设有专门的中医药管理部门，负责组织和实施相关政策，卫生健康行政部门还会定期对中医针灸师进行考核，以确保其专业水平和服务质量。
4、中医药行业协会：中医药行业协会是一个非营利性的行业组织，旨在推动中医药事业的发展，协会通常会组织各类培训、交流和学术活动，提高会员的专业水平和服务能力，协会还会协助卫生健康行政部门开展中医针灸师的培训和考试工作，为行业内的专业人才提供更多的发展机会。
5、社会组织和个人执业机构：除了以上单位外，还有一些社会组织和个人执业机构提供中医针灸师证办理服务，这些机构通常具有一定的资质和经验，能够为有需求的人员提供专业的培训和考试指导，由于缺乏统一的管理和服务标准，这类机构的信誉和服务水平参差不齐，因此在选择时需要谨慎。
想要办理中医针灸师证的人员可以通过多种途径寻求帮助，在选择办理机构时，建议优先考虑正规的中医药院校、培训机构或卫生健康行政部门等单位，以确保所获得的证书具有较高的权威性和可信度，还需要关注相关的政策和法规，了解行业动态和发展趋势，以便更好地规划自己的职业发展道路。