家庭教育指导师是哪里发证机构，这是一个非常重要的问题，家庭教育指导师的发证机构主要有以下几个：

1、中国人事部人才交流服务中心：该机构是国家级人才服务机构，负责全国范围内的人才交流、培训、评价等工作，家庭教育指导师证书由中国人事部人才交流服务中心颁发，具有很高的权威性和认可度。

2、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会是一个专业性很强的社会组织，致力于推动心理健康事业的发展，该协会的家庭教育指导师培训课程非常系统和完善，学员通过培训和考试可以获得家庭教育指导师证书。

3、各省市教育局：各省市教育局也会组织家庭教育指导师的培训和考试工作，颁发相应的证书，这种方式的优点是更加贴近实际需求，但是权威性和认可度相对较低。

4、其他专业培训机构：除了以上几个主要的发证机构外，还有一些专业的培训机构也提供家庭教育指导师的培训和考试服务，这些机构的证书虽然有一定的参考价值，但是权威性和认可度较低。

选择哪种方式获得家庭教育指导师证书需要根据自己的实际情况来决定，如果你希望获得权威性和认可度较高的证书，可以选择中国人事部人才交流服务中心或中国心理卫生协会颁发的证书；如果你更注重实用性和灵活性，可以选择各省市教育局或其他专业培训机构提供的证书，无论选择哪种方式，都需要认真对待培训课程和考试内容，不断提升自己的专业素养和能力水平。