中医理疗师证颁发机构是指负责对中医理疗师进行资格认证和资质审核的官方机构，在中国，中医理疗师证的颁发主要由以下几个部门或单位负责：
1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国卫生行业的主管部门，NHC负责制定中医理疗师的职业标准和培训大纲，对中医理疗师的培训和考试进行监督和管理，NHC还负责对中医理疗师的资格认证进行审核，确保中医理疗师具备相应的专业知识和技能。
2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会(Health Commission of the relevant province, autonomous region or municipality):在NHC的指导下，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会负责本地区的中医理疗师培训工作，包括制定培训计划、组织培训课程、实施培训考核等，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会还负责对本地区中医理疗师的资格认证进行审核。
3、中医药行业管理部门：中医药行业管理部门主要包括国家中医药管理局(State Administration of Traditional Chinese Medicine,简称SATCM)和国家中医药发展局(National Bureau of Traditional Chinese Medicine Development,简称NBTD)，SATCM负责制定中医药行业的发展规划和政策，对中医药行业进行监管，NBTD则负责推动中医药行业的科技创新和国际交流合作，这两个部门在中医药行业管理中发挥着重要作用，对中医理疗师的培训和资格认证也有一定的参与和指导作用。
4、中医药院校：中医药院校是培养中医理疗师的主要基地，各级中医药院校负责开展中医理疗师的专业教育和培训工作，包括理论教学、实践操作、实习实训等，通过系统的学习和实践，学生可以掌握中医理疗的基本知识和技能，为今后从事中医理疗工作打下坚实的基础。
5、其他相关机构：除了以上几个主要的颁发机构外，还有一些其他相关机构也会参与到中医理疗师证的颁发工作中，一些行业协会、专业培训机构、职业资格鉴定中心等，它们会与相关部门合作，共同推动中医理疗师证的发放和管理。
中医理疗师证的颁发涉及到多个部门和单位的协同合作，这些部门和单位共同制定了中医理疗师的职业标准和培训大纲，对中医理疗师的培训和考试进行监督和管理，确保中医理疗师具备相应的专业知识和技能，在考取中医理疗师证的过程中，考生需要参加由相关部门组织的培训课程和考试，通过考试后才能获得中医理疗师证。