中医药针灸师证书课程内容主要包括以下几个方面的内容：
1、中医基础理论知识
中医药针灸师首先需要掌握中医基础理论知识，包括中医的基本概念、基本原理、基本诊断方法、基本治疗原则等，这部分内容主要包括《黄帝内经》、《伤寒论》、《金匮要略》等经典著作的学习，以及中医五行、阴阳、脏腑等方面的理论知识。
2、中药学知识
中医药针灸师需要具备一定的中药学知识，以便在治疗过程中能够根据病情选择合适的中药进行治疗，这部分内容主要包括中药的基本概念、分类、性味归经、功效、配伍禁忌等，还需要学习常用中药的炮制方法、制剂工艺、质量控制等方面的知识。
3、针灸学知识
针灸是中医药的重要治疗方法之一，中医药针灸师需要具备扎实的针灸学知识，这部分内容主要包括针刺手法、穴位定位、针刺深浅度、疗程等方面的知识，还需要学习电针、温针、浮针等特殊针法的治疗原理和操作技巧。
4、推拿按摩学知识
推拿按摩是中医药的另一种重要治疗方法，中医药针灸师需要掌握推拿按摩的基本理论和操作技巧，这部分内容主要包括推拿按摩的基本原理、手法技巧、适应症、禁忌症等方面的知识，还需要学习各种推拿按摩疗法的注意事项和操作方法。
5、经络学知识
经络是中医学的核心概念之一，贯穿于中医的各个领域，中医药针灸师需要掌握经络学的基本知识，以便在治疗过程中能够正确地辨识经络病变和进行经络调理，这部分内容主要包括经络的基本概念、经络系统的组成、经络运行规律、经络病证等内容。
6、体质辨识与调理方法
体质是影响人体健康和疾病发生的重要因素，中医药针灸师需要具备一定的体质辨识和调理能力，这部分内容主要包括体质分类、体质特点、体质调理方法等内容，还需要学习如何根据患者的体质制定个性化的治疗方案。
7、临床实践技能培训
中医药针灸师证书课程通常会安排临床实践技能培训，使学员能够在实际工作中积累经验，提高临床诊疗水平，这部分内容主要包括模拟病例讨论、实际患者诊疗、常见病症的诊治方法等。
8、法律法规与职业道德教育
中医药针灸师在从事临床工作时，需要遵守相关的法律法规，同时具备良好的职业道德，课程中还会安排法律法规与职业道德教育的内容，使学员了解相关法律法规，树立正确的职业观念。
9、专业软件操作培训
现代医学技术的发展，使得中医药针灸师需要掌握一些专业软件，以提高工作效率，这部分内容主要包括中医诊断软件、针灸处方软件、病例管理系统等软件的操作培训。
中医药针灸师证书课程涵盖了中医基础理论知识、中药学知识、针灸学知识、推拿按摩学知识、经络学知识、体质辨识与调理方法、临床实践技能培训、法律法规与职业道德教育以及专业软件操作培训等方面的内容，旨在培养具备扎实的专业知识和技能，能够独立开展临床工作的中医药针灸师。