中医针灸理疗师证书颁发机构主要分布在全国各地的中医药管理部门、卫生行政部门、职业技能鉴定机构以及中医药大学等，这些机构负责对从事中医针灸理疗师职业的人员进行资格认证，确保其具备相应的专业技能和知识，以下是一些主要的中医针灸理疗师证书颁发机构：
1、国家中医药管理局：作为国家级卫生健康行政部门，国家中医药管理局负责全国中医药行业的管理和监督工作，其下设有多个司局，其中包括针灸医疗司，负责中医针灸理疗师的培训、考试和证书颁发等工作。
2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在国家中医药管理局的指导下，负责本地区的中医药管理工作，各地卫生健康委员会下设中医药管理部门，负责中医针灸理疗师的培训、考试和证书颁发等工作。
3、卫生行政部门：除国家和地方卫生健康委员会外，各级卫生行政部门也参与中医针灸理疗师的培训、考试和证书颁发工作，国家卫生计生委、国家中医药管理局等部门在各地设有分支机构，负责相关事务。
4、职业技能鉴定机构：职业技能鉴定机构是负责职业技能鉴定工作的专门机构，为从事中医针灸理疗师职业的人员提供技能水平测试和证书颁发服务，中国职业技能鉴定指导中心、各省职业技能鉴定中心等机构。
5、中医药大学：中医药大学作为中医药高等教育和科研的重要基地，承担着培养中医针灸理疗师的任务，学校内设有相关专业的教育培训部门，负责学生的培训和实践教学，并为合格学生颁发中医针灸理疗师证书。
6、其他相关机构：还有一些其他机构也参与中医针灸理疗师证书的颁发工作，如民间中医针灸协会、中医药行业协会等，这些组织通过组织培训、考试等方式，为符合条件的人员颁发中医针灸理疗师证书。
中医针灸理疗师证书颁发机构遍布全国各地，涉及多个政府部门和教育机构，从事中医针灸理疗师职业的人员需要通过相应的培训和考试，获得证书后才能在医疗机构或养老服务机构等场所开展工作。