如果您的二级心理咨询师证书丢失了，您需要办理注销手续，具体流程如下：
1、登录国家人力资源和社会保障部官网，进入“职业资格证书查询”页面，输入您的证书编号和姓名进行查询，如果查询结果显示您的证书已经作废，那么您需要办理注销手续。
2、如果您的证书没有作废，那么您需要联系颁发机构进行补办，颁发机构会要求您提供身份证明、照片等材料，并收取一定的费用。
3、如果您无法联系到颁发机构或者颁发机构拒绝为您提供服务，那么您可以向当地人力资源和社会保障部门投诉，当地人力资源和社会保障部门会对此进行调查，并根据情况给出相应的处理意见。
4、如果以上方法都无法解决问题，那么您可以向法院提起诉讼，要求注销该证书，在诉讼过程中，您需要提供相关证据证明该证书已经丢失或者作废。
需要注意的是，不同地区的具体办理流程可能会有所不同，在办理注销手续时，建议您先了解一下当地的具体政策和要求，也要注意保护好自己的个人信息和证件安全。