国家二级心理咨询师证书颁发机构是指负责对符合国家二级心理咨询师资格考试要求的考生进行资格审核、考试评估和证书颁发的具有权威性的社会组织或政府部门，在中国，国家二级心理咨询师证书颁发机构主要由以下几个部门承担：
1、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会(CPA)是中国心理学界的全国性、非营利性社会组织，成立于1952年，其宗旨是促进心理卫生事业的发展，提高人民心理健康水平，维护人民群众的精神健康权益，中国心理卫生协会负责组织和管理国家二级心理咨询师资格考试，对考生进行资格审核、考试评估和证书颁发。
2、各省、自治区、直辖市心理学会：各省、自治区、直辖市心理学会是地方性的心理卫生组织，由当地心理卫生工作者自愿组成，各省、自治区、直辖市心理学会负责在本地区组织和管理国家二级心理咨询师资格考试，对考生进行资格审核、考试评估和证书颁发。
3、高校心理学专业教学指导委员会：高校心理学专业教学指导委员会是由国内知名高校心理学专家组成的学术组织，负责对高校心理学专业教学进行指导和评估，部分高校心理学专业教学指导委员会也承担国家二级心理咨询师资格考试的组织和管理工作。
4、企事业单位和社会组织开展的心理咨询培训和认证：一些企事业单位和社会组织开展的心理咨询培训和认证活动，也会对参加培训并通过考核的学员颁发国家二级心理咨询师证书，这些组织的资质和认可程度可能因地区和单位而异，需要具体咨询相关组织了解。
需要注意的是，获得国家二级心理咨询师证书的人员，应当具备相应的专业知识和技能，能够为个人和团体提供专业的心理咨询服务，随着心理咨询行业的发展，国家对心理咨询师的职业素养和服务质量也提出了更高的要求，从事心理咨询工作的人员应当不断提升自己的专业能力和服务水平，以更好地满足社会和个人的需求。