中科院心理咨询师证授权机构的审批部门主要包括以下几个方面：
1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府部门，国家卫生健康委员会负责制定和实施全国范围内的卫生政策、法规和标准，在心理咨询师培训和考试方面，NHC会监督和管理整个行业的发展，确保心理咨询师的选拔和培训工作符合国家要求，NHC还会对授权机构进行备案管理，确保其具备相应的资质和条件。
2、中国科学院心理研究所(Institute of Psychology, Chinese Academy of Sciences,简称IPC):作为中国心理学研究的重要机构，中国科学院心理研究所在心理咨询领域具有较高的声誉和权威性，IPC会对授权机构的培训课程、教学大纲、师资队伍等方面进行审核，确保其具备一定的教学质量和水平，IPC还会对授权机构进行定期评估，以保证其持续符合国家标准和要求。
3、中国心理学会(Chinese Psychological Association,简称CPA):作为中国心理学界的专业组织，中国心理学会负责推动心理学的发展和普及，促进心理学研究和应用的交流与合作，在心理咨询师培训和考试方面，中国心理学会会与授权机构合作，共同制定培训课程和考试标准，确保心理咨询师的专业素质和能力，中国心理学会还会对授权机构进行指导和监督，确保其合规经营和服务质量。
4、其他相关部门：除了上述三个主要的审批部门外，还有一些其他相关部门也会对心理咨询师证授权机构进行审批和管理，教育部门会负责对培训机构进行审批和监管；人力资源和社会保障部门会负责对培训机构的师资队伍进行审核；市场监管部门会负责对培训机构的经营行为进行监督等，这些部门的协同合作，有助于确保心理咨询师证授权机构的合规性和专业性。
中科院心理咨询师证授权机构的审批部门涉及多个层面，包括国家卫生健康委员会、中国科学院心理研究所、中国心理学会以及其他相关部门，这些部门通过严格的审核和管理，确保了心理咨询师证授权机构具备相应的资质和条件，为社会提供优质的心理咨询服务。