1、申请人提交书面申请：申请人需向所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构提交书面申请，说明补办原因、证书遗失情况等。
2、提供相关证明材料：申请人需提供身份证明、学历证明、职业资格证书等相关证明材料。
3、填写《心理咨询师职业资格证书补办申请表》：申请人需按照要求填写《心理咨询师职业资格证书补办申请表》，并加盖所在单位或学校印章。
4、提交相关证明材料和申请表：申请人将填好的申请表和相关证明材料一并提交给所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构。
5、受理和审核：所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构在收到申请后，进行受理和审核，如申请人提交的材料齐全、真实有效，符合补办条件，则予以受理；如申请人提交的材料不齐全或不符合补办条件，则不予受理。
6、公告和公示：对于已受理的补办申请，所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构需在官方网站上进行公告和公示，公示期为7个工作日。
7、颁发证书：公示期满无异议的，所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构方可颁发证书，并将颁发证书的信息报送国家人力资源和社会保障部。
8、收缴原证书：对于已颁发的新证书，原持有人需到所在地省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构领取原证书，并交回注销。
根据《国家职业资格证书管理办法》规定，职业资格证书的申领、换发、变更等费用由申请人承担，具体费用标准如下：
1、证书工本费：根据不同地区的规定，证书工本费一般在100元至300元之间。
2、公告和公示费用：公告和公示期间，省级人力资源和社会保障部门或者其委托的机构需支付一定的费用用于发布公告和公示信息，具体费用标准因地区而异，一般在100元至300元之间。
3、证书制作费用：证书制作过程中需要支付一定的费用，包括证书印制、封装等，具体费用标准因地区而异，一般在100元至300元之间。
国家三级心理咨询师证书补办的总费用一般在500元至1000元之间，需要注意的是，不同地区的具体费用标准可能会有所差异，因此建议在办理补办手续前，先向当地相关部门咨询了解具体的费用标准。