健康管理师证考试分为两科，考试内容分为基础知识和操作技能。
基础知识章节分值占比如下：第一章 健康管理概论 2-3分；第二章 临床医学基础知识 5-8分；第三章 预防医学基础知识 3-6分；第四章 慢性病 13-17分；第五章 流行病和医学统计学 9-12分；第六章 健康教育学 7-10分；第七章 营养与食品安全 5-8分；第八章 身体活动基本知识 7-10分；第九章 心理健康 4-6分；第十章 中医养生学基础知识 2-3分；第十一章 康复医学基础知识 3-5分；第十二章 健康信息学 7-10分；第十三章 医学伦理与职业道德 2-5分。
操作技能考试内容包括：健康监测、健康风险评估与分析、健康指导、健康危险因素干预、健康管理案例。